Считывание значений и базовые геометрические операции представляют собой основу любой программы обработки данных. Gwyddion предлагает большой набор функций для масштабирования данных, вращения, изменения числа точек и извлечения профилей. Этот раздел описывает эти простые, но нужные функции.
С помощью основных модулей можно совершить следующие операции с двумерным полем данных:
Простейший способ чтения данных это поместить мышиный курсор поверх точки. в которой необходимо считать значение. Координаты при этом показываются в строке состояния окна данных или окна графика.
Инструмент Считать значение предлагает больше вариантов чтения данных. Он показывает координаты и значения в последней точке окна данных, где была нажата кнопка мыши. Он может усреднить значение в круговой окрестности выбранной точки, это управляется опцией Радиус усреднения. Если этот радиус равен 1, показывается значение в единичной точке (как делает простейший метод). Кнопка сдвигает поверхность таким образом, чтобы сделать текущее z новым нулевым уровнем.
Считать значение также может показывать наклон локальной грани. Радиус усреднения снова определяет радиус области, используемой для аппроксимации плоскостью.
Во всех инструментах Gwyddion, наклоны плоскости и грани показываются в сферических углах (ϑ, φ) вектора нормали к плоскости.
Угол ϑ является углом между направлением вверх и нормалью, это означает, что ϑ = 0 для горизонтальных граней и увеличивается с наклоном. Угол всегда больше нуля.
Угол φ - угол между осью x и проекцией нормали на плоскость xy, отсчитываемый против часовой стрелки, как показано на следующем рисунке. Для граней это означает, что φ соответствует направлению грани вниз.
Расстояния и разницы могут измеряться с помощью инструмента расстояние. Он показывает горизонтальное (Δx), вертикальное (Δy) расстояния и общее расстояние по плоскости (R); азимут φ (измеряется так же, как наклон φ ) и разницу значений конечных точек Δz для набора выбранных на массиве данных линий.
Расстояния могут быть скопированы в буфер обмена или сохранены в текстовый файл с помощью кнопок под списком.
Инструмент извлечения профиля доступен с панели инструментов. Можно использовать мышь для рисования нескольких профилей на изображении, которые впоследствии могут быть перемещены и выровнены. Диалоговое окно включает в себя мгновенный предпросмотр графика. Профили могут быть различной «толщины», что означает использование большего числа точек данных в направлении поперёк направления профиля для расчёта точки профиля для более широких профилей. Это может быть весьма полезно для уменьшения шума при измерении объектов правильной формы.
После того, как профили выбраны, они могут быть извлечены в графики (как отдельные, так и сгруппированные в одном окне графика), которые в свою очередь могут быть проанализированы соответствующими функциями.
Кривая профиля строится по данным, извлеченным через регулярные интервалы вдоль выбранной линии. Значения в точках, которые не попадают точно в центр пикселя (что обычно случается с наклонными линиями) интерполируются с использованием выбранного режима интерполяции. Если не задано определённое число точек с помощью опции Фикс. разр., число точек соответствует длине линии в пикселях. Это означает, что для полностью горизонтальных и вертикальных линий интерполяция не используется.

Иллюстрация выборки данных при извлечении профиля для наклонных линий. Схемы слева показывают точки вдоль линии где считываются данные для естественного и очень высокого разрешения. Графики справа показывают извлечённые значения. Сравнение естественного профиля и профиля высокого разрешения снятых с интерполяцией округлением показывает, что действительно точки данных кривой с естественным разрешением образуют подмножество точек профиля высокого разрешения. Влияние метода интерполяции на значения данных вне узлов сетки показано на нижних двух графиках, сравнивающих интерполяцию округлением и бикубическую при высоком разрешении.