Главное окно, также называемое окном инструментов, является одним из двух окон, которые запускаются при старте Gwyddion (если не заданы файлы, которые нужно открыть), другое — это браузер данных. Закрытие этого окна приводит к выходу из Gwyddion.
Окно инструментов содержит набор меню Gwyddion и несколько строк с кнопками, связанными с обычными функциями и инструментами. В меню функции сгруппированы следующим образом:
объединяет команды, которые используются для загрузки и сохранения файлов. Некоторые из глобальных команд (например, ) также расположены здесь. История недавно открытых файлов может просматриваться командой → → .
предоставляет команды управления историей редактирования (масок.
, ) и редакторы для различных глобальных ресурсов, таких как градиенты и материалы для представления данных в шкале пседоцвета и трёхмерном виде или цвета по умолчанию, используемого дляавтоматически строится из всех модулей обработки данных, расположенных в каталоге module установки Gwyddion (зависит от операционной системы). Это меню вместе с панелью кнопок Инструменты содержит большую часть команд, которые могут понадобиться для анализа данных СЗМ. Подмножество этих функций также доступно на панели кнопок Обработка данных. Эти кнопки служат кнопками быстрого запуска часто используемых функций из одноимённого меню. Все функции, доступные на этой панели, также можно найти и в меню.
подобен Обработка графиков включает в себя аппроксимацию функциями, экспорт данных графиков и т.п. Панель кнопок График снова содержит подмножество наиболее часто используемых функций меню .
, за исключением того, что состоит из функций для работы с графиками.подобно функциям объёмными данными.
, за исключением того, что содержит функции работы сподобно функциям данными XYZ.
, за исключением того, что содержит функции работы сподобно функциям карт кривых.
, за исключением того, что содержит функции работы с даннымисодержит команды, которые представляют вспомогательную информацию о Gwyddion, такие как версия программы и список загруженных модулей вместе с содержащимися в них функциями. Также там находится команда включения браузера данных.
И, наконец, можно найти в главном окне несколько рядов кнопок. Кнопки в панели Вид предоставляют различные функции масштабирования (которые чаще проще вызвать с помощью комбинации клавиш или просто изменяя размер окна данных) и представления данных в трёхмерном виде. Панели Обработка данных и График содержат избранные функции из меню и , описанные выше.
Панель Инструменты содержит инструменты, т.е. функции, которые напрямую работают с выбранным в окне данных. Эти функции доступны только с этой панели кнопок.
Группы кнопок в панели инструментов можно менять используя меню
→ , вплоть до полного удаления отдельных групп и создания абсолютно новых.